Tullen har fem avdelningar samt tjänsteenheter. Två av avdelningarna – kundrelations- och riskhanteringsavdelningen samt informations- och teknologiavdelningen– möjliggör i stor utsträckning informationsbaserad ledning och därmed en effektiv och resultatrik inriktning av verksamheten. De tre övriga avdelningarna – tullklarerings- och beskattningsavdelningen, tullbevakningsavdelningen och tullbrottsutredningsavdelningen– är tätt integrerade kring Tullens kärnverksamheter som verkställare av Tullens operativa funktioner. Tullen leds av generaldirektören.
Tullens ledningsgrupp
Sami Rakshit, generaldirektör
Stefan Aniszewsk, staben
Samy Gardemeister, kundrelations- och riskhanteringsavdelningen
Tom Ferm, tullklarerings- och beskattningsavdelningen
Mikko Grönberg, tullbevakningsavdelningen
Petri Lounatmaa, tullbrottsutredningsavdelningen
Pirjo Sainio, informations- och teknologiavdelningen